RadOnc {RadOnc} | R Documentation |
DVH data for 'John Doe' and 'Jane Doe'; 3D structural data for 'cord', 'mandible', and 'teeth'; RT data for 'Jane Doe'; and a zDVH object for 'stomach'
Description
List of 10 DVH objects corresponding to structures (e.g. liver) for patients 'John Doe' and 'Jane Doe'; Two structure3D objects ('cord' and 'mandible') and one structure list ('teeth') containing 3 structures; an RTdata object for 'Jane Doe' containing dose grid information and a structure list with 3 structures; and one zDVH object ('stomach').
Usage
data(package="RadOnc")
Format
The format for johndoe
is:
Formal class 'DVH.list' [package "RadOnc"] with 1 slots ..@ structures:List of 10 .. ..$ LIVER :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "LIVER" .. .. .. ..@ structure.volume: num 1367 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 92.9 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 4.9 .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. ..@ dose.STD : num 10.8 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 1367 414 392 378 368 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ SMALL_BOWEL :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "SMALL_BOWEL" .. .. .. ..@ structure.volume: num 206 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 99.8 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 4.3 .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. ..@ dose.STD : num 15.3 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 206.2 43.1 39.5 37.4 35.8 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ DUODENUM :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "DUODENUM" .. .. .. ..@ structure.volume: num 93.1 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 102 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 70.7 .. .. .. ..@ dose.median : num 81.3 .. .. .. ..@ dose.mode : num 100 .. .. .. ..@ dose.STD : num 30.3 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 93.1 93.1 93 93 92.9 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ STOMACH :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "STOMACH" .. .. .. ..@ structure.volume: num 304 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 101 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 7.9 .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. ..@ dose.STD : num 22.8 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 303.6 78 71.5 67.8 65.1 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ CTV :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "CTV" .. .. .. ..@ structure.volume: num 88.4 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 103 .. .. .. ..@ dose.min : num 96.8 .. .. .. ..@ dose.mean : num 100 .. .. .. ..@ dose.median : num 100 .. .. .. ..@ dose.mode : num 100 .. .. .. ..@ dose.STD : num 0.7 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 88.4 88.4 88.4 88.4 88.4 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ PTV :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "PTV" .. .. .. ..@ structure.volume: num 156 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 103 .. .. .. ..@ dose.min : num 84.1 .. .. .. ..@ dose.mean : num 99.6 .. .. .. ..@ dose.median : num 99.8 .. .. .. ..@ dose.mode : num 99.9 .. .. .. ..@ dose.STD : num 1.2 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 156 156 156 156 156 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ BODY :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "BODY" .. .. .. ..@ structure.volume: num 17666 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 103 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 5.6 .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. ..@ dose.STD : num 17.1 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 17666 3424 3290 3206 3143 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ LEFT_KIDNEY :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "LEFT_KIDNEY" .. .. .. ..@ structure.volume: num 154 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 44.4 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 4.7 .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. ..@ dose.STD : num 9.5 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 154.2 48.3 46.4 45.3 44.4 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ RIGHT_KIDNEY:Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "RIGHT_KIDNEY" .. .. .. ..@ structure.volume: num 155 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 98.5 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 24.2 .. .. .. ..@ dose.median : num 24.3 .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. ..@ dose.STD : num 22.8 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 155 134 132 130 129 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute" .. ..$ CORD :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "John Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "5555555555" .. .. .. ..@ structure.name : chr "CORD" .. .. .. ..@ structure.volume: num 40.7 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 55.5 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 20.7 .. .. .. ..@ dose.median : num 4.1 .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. ..@ dose.STD : num 23.2 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1026] 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "relative" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1026] 40.7 23 22.7 22.4 22.2 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "absolute"
The format for janedoe
is:
Formal class 'DVH.list' [package "RadOnc"] with 1 slots ..@ structures:List of 10 .. ..$ LIVER :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "LIVER" .. .. .. ..@ structure.volume: num 1636 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 5634 .. .. .. ..@ dose.min : num 42.7 .. .. .. ..@ dose.mean : num 707 .. .. .. ..@ dose.median : num 276 .. .. .. ..@ dose.mode : num 99.5 .. .. .. ..@ dose.STD : num 917 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ LEFT_KIDNEY :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "LEFT_KIDNEY" .. .. .. ..@ structure.volume: num 196 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 3847 .. .. .. ..@ dose.min : num 75.8 .. .. .. ..@ dose.mean : num 1021 .. .. .. ..@ dose.median : num 703 .. .. .. ..@ dose.mode : num 119 .. .. .. ..@ dose.STD : num 802 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ STOMACH :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "STOMACH" .. .. .. ..@ structure.volume: num 695 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 5353 .. .. .. ..@ dose.min : num 59 .. .. .. ..@ dose.mean : num 1280 .. .. .. ..@ dose.median : num 1302 .. .. .. ..@ dose.mode : num 111 .. .. .. ..@ dose.STD : num 1062 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ DUODENUM :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "DUODENUM" .. .. .. ..@ structure.volume: num 34.2 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 5620 .. .. .. ..@ dose.min : num 2708 .. .. .. ..@ dose.mean : num 4755 .. .. .. ..@ dose.median : num 4943 .. .. .. ..@ dose.mode : num 5365 .. .. .. ..@ dose.STD : num 635 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ RIGHT_KIDNEY:Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "RIGHT_KIDNEY" .. .. .. ..@ structure.volume: num 224 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 4202 .. .. .. ..@ dose.min : num 102 .. .. .. ..@ dose.mean : num 1511 .. .. .. ..@ dose.median : num 1624 .. .. .. ..@ dose.mode : num 1638 .. .. .. ..@ dose.STD : num 714 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ CTV :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "CTV" .. .. .. ..@ structure.volume: num 147 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 5647 .. .. .. ..@ dose.min : num 5169 .. .. .. ..@ dose.mean : num 5500 .. .. .. ..@ dose.median : num 5505 .. .. .. ..@ dose.mode : num 5500 .. .. .. ..@ dose.STD : num 59.8 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ PTV :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "PTV" .. .. .. ..@ structure.volume: num 239 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 5665 .. .. .. ..@ dose.min : num 4750 .. .. .. ..@ dose.mean : num 5471 .. .. .. ..@ dose.median : num 5493 .. .. .. ..@ dose.mode : num 5500 .. .. .. ..@ dose.STD : num 98.6 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ SMALL_BOWEL :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "SMALL_BOWEL" .. .. .. ..@ structure.volume: num 232 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 4934 .. .. .. ..@ dose.min : num 59.6 .. .. .. ..@ dose.mean : num 294 .. .. .. ..@ dose.median : num 171 .. .. .. ..@ dose.mode : num 127 .. .. .. ..@ dose.STD : num 391 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ CORD :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "CORD" .. .. .. ..@ structure.volume: num 64.9 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 3443 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 732 .. .. .. ..@ dose.median : num 136 .. .. .. ..@ dose.mode : num 6.9 .. .. .. ..@ dose.STD : num 953 .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. ..@ dose.rx : num 5500 .. .. .. ..@ dose.fx : num 25 .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. ..@ doses : num [1:1133] 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 ... .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. ..@ volumes : num [1:1133] 100 98.5 95.9 93.8 90.8 ... .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ BODY :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. ..@ patient : chr "Jane Doe" .. .. .. ..@ ID : chr "1111111111" .. .. .. ..@ structure.name : chr "BODY" .. .. .. ..@ structure.volume: num 25508 .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. ..@ dose.max : num 5665 .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. ..@ dose.mean : num 478 .. .. 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The format for janedoe.RTdata
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The format for cord
is:
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[1:20, 1:3] -4.88 -2.93 -0.98 0.52 0.98 1.85 2.15 1.66 0.98 -0.07 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] -2.93 -2.44 -0.98 0.98 1.28 2.33 2.26 1.4 0.98 -0.73 ... .. ..$ : num [1:20, 1:3] -4.88 -2.93 -0.98 0.98 1.88 2.93 2.99 3.22 2.93 2.26 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] -2.93 -0.98 -0.02 0.98 2.7 2.93 3.43 3.38 2.93 2.4 ... .. ..$ : num [1:20, 1:3] -2.93 -0.98 0.84 0.98 2.87 2.93 3.63 3.33 2.93 1.89 ... .. ..$ : num [1:20, 1:3] -2.93 -0.98 0.98 1.88 2.93 3.45 3.56 2.93 2.62 0.98 ... .. ..$ : num [1:18, 1:3] -4.88 -2.93 -0.98 0.98 2.41 2.93 3.44 3.4 2.93 2.47 ... .. ..$ : num [1:20, 1:3] -4.88 -2.93 -0.98 0.98 2.34 2.93 3.63 3.56 2.93 2.38 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] -0.98 -0.37 0.98 2.5 2.93 3.63 3.56 2.93 2.38 0.98 ... .. ..$ : num [1:20, 1:3] -0.98 -0.37 0.98 2.64 2.93 3.43 3.4 2.93 2.47 0.98 ... .. ..$ : num [1:20, 1:3] -2.93 -0.98 0.37 0.98 2.75 2.93 3.56 3.33 2.93 2.01 ... .. .. [list output truncated] .. ..- attr(*, "dim")= int [1:2] 130 1 ..@ DVH :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. ..@ patient : chr "" .. .. ..@ ID : chr "" .. .. ..@ structure.name : chr "" .. .. ..@ structure.volume: num 0 .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. ..@ dose.max : num 0 .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. ..@ dose.mean : num 0 .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. ..@ dose.STD : num 0 .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. ..@ dose.rx : num 0 .. .. ..@ dose.fx : num 0 .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. ..@ doses : num(0) .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. ..@ volumes : num(0) .. .. ..@ volume.type : chr "relative"
The format for mandible
is:
Formal class 'structure3D' [package "RadOnc"] with 9 slots ..@ name : chr "Mandible" ..@ volume : num 0 ..@ volume.units : chr "cc" ..@ coordinate.units: chr "cm" ..@ vertices : num [1:6994, 1:3] -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 ... .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2 .. .. ..$ : chr [1:6994] "" "" "" "" ... .. .. ..$ : NULL ..@ origin : num [1:3] -1.93 -151.83 -122.85 ..@ triangles : num [1:3, 1:13984] 46 47 49 48 1 50 1 2 51 2 ... ..@ closed.polys :List of 104 .. ..$ : num [1:48, 1:3] -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 ... .. ..$ : num [1:52, 1:3] -14.65 -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 ... .. ..$ : num [1:68, 1:3] -14.65 -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 ... .. ..$ : num [1:74, 1:3] -14.65 -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 ... .. ..$ : num [1:80, 1:3] -6.84 -6.51 -4.88 -2.93 -0.98 0.98 1.17 2.93 4.88 6.08 ... .. ..$ : num [1:90, 1:3] -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 ... .. ..$ : num [1:94, 1:3] -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 ... .. ..$ : num [1:98, 1:3] -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 ... .. ..$ : num [1:110, 1:3] -8.79 -6.84 -5.62 -4.88 -2.93 -0.98 0.98 1.27 2.93 4.77 ... .. ..$ : num [1:118, 1:3] -8.79 -6.84 -5.09 -4.88 -2.93 -0.98 0.98 1.52 2.93 4.88 ... .. ..$ : num [1:124, 1:3] -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 -0.98 -0.61 0.98 2.93 3.35 4.88 ... .. ..$ : num [1:136, 1:3] -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 -0.98 0.94 0.98 2.93 4.88 5.94 ... .. ..$ : num [1:140, 1:3] -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 ... .. ..$ : num [1:150, 1:3] -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 -2.66 -0.98 0.98 2.93 4.88 5.28 ... .. ..$ : num [1:154, 1:3] -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 ... .. ..$ : num [1:172, 1:3] -10.74 -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 ... .. ..$ : num [1:178, 1:3] -14.65 -12.7 -10.74 -8.79 -6.84 ... .. ..$ : num [1:184, 1:3] -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 -1.95 -0.98 0.98 2.93 4.88 6.84 ... .. ..$ : num [1:202, 1:3] -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 -1.46 -0.98 0.98 2.93 4.88 6.84 ... .. ..$ : num [1:210, 1:3] -8.79 -6.84 -4.88 -2.93 -0.98 0.9 0.98 2.93 4.88 6.84 ... .. ..$ : num [1:108, 1:3] -0.98 0.98 1.95 2.93 3.91 4.88 6.84 6.98 8.79 9.94 ... .. ..$ : num [1:94, 1:3] -20.5 -18.6 -16.6 -14.7 -12.7 ... .. ..$ : num [1:94, 1:3] 12.7 14.7 15.5 16.6 17.3 ... .. ..$ : num [1:84, 1:3] -26.4 -24.4 -22.5 -20.9 -20.5 ... .. ..$ : num [1:94, 1:3] 14.7 15.3 16.6 17.4 18.6 ... .. ..$ : num [1:86, 1:3] -26.4 -24.4 -22.7 -22.5 -20.5 ... .. ..$ : num [1:90, 1:3] 12.7 14.7 16.6 18.3 18.6 ... .. ..$ : num [1:82, 1:3] -26.4 -24.4 -22.5 -22 -20.5 ... .. ..$ : num [1:80, 1:3] 22.5 24.4 24.8 26.4 26.9 ... .. ..$ : num [1:76, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -24.4 -22.5 ... .. ..$ : num [1:78, 1:3] 20.5 22.5 24.4 26.1 26.4 ... .. ..$ : num [1:74, 1:3] -32.2 -30.3 -28.3 -26.4 -24.4 ... .. ..$ : num [1:74, 1:3] -32.2 -30.3 -28.3 -26.4 -24.4 ... .. ..$ : num [1:76, 1:3] 20.5 22.5 24.4 26.4 27.2 ... .. ..$ : num [1:72, 1:3] -32.2 -30.3 -28.3 -26.4 -24.6 ... .. ..$ : num [1:72, 1:3] 22.5 24.4 26.4 28.3 30.3 ... .. ..$ : num [1:72, 1:3] -32.2 -30.3 -28.3 -26.4 -25.6 ... .. ..$ : num [1:70, 1:3] 22.5 24.4 26.4 28.3 30.3 ... .. ..$ : num [1:68, 1:3] -36.1 -34.2 -32.2 -30.3 -28.3 ... .. ..$ : num [1:70, 1:3] 24.4 26.4 28.3 30.3 32.2 ... .. ..$ : num [1:70, 1:3] 30.3 32.2 34.2 36.1 38.1 ... .. ..$ : num [1:68, 1:3] -38.1 -36.1 -34.2 -32.8 -32.2 ... .. ..$ : num [1:66, 1:3] 34.2 36.1 37.7 38.1 39.3 ... .. ..$ : num [1:64, 1:3] -42 -40 -38.1 -36.1 -34.2 ... .. ..$ : num [1:66, 1:3] 36.1 36.8 38.1 38.7 39.8 ... .. ..$ : num [1:62, 1:3] -44 -42 -40 -38.1 -36.1 ... .. ..$ : num [1:64, 1:3] 36.1 36.8 38.1 39.2 40 ... .. ..$ : num [1:60, 1:3] -40 -38.1 -36.1 -34.7 -34.2 ... .. ..$ : num [1:62, 1:3] 36.1 36.6 38.1 39.5 40 ... .. ..$ : num [1:56, 1:3] -42 -40 -38.1 -36.1 -34.2 ... .. ..$ : num [1:62, 1:3] 36.1 36.3 38.1 39.3 40 ... .. ..$ : num [1:56, 1:3] -42 -40 -38.1 -36.1 -34.2 ... .. ..$ : num [1:60, 1:3] 34.2 36.1 38.1 39 40 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] -44 -42 -40 -38.7 -38.1 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] 34.2 36.1 38.1 38.8 40 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] -44 -42 -40 -39.4 -38.1 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] 34.2 36.1 38.1 39.2 40 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] -44 -42 -40 -39.4 -38.1 ... .. ..$ : num [1:56, 1:3] 36.1 38.1 38.9 40 40.3 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] -42 -41.9 -40 -39.6 -38.1 ... .. ..$ : num [1:56, 1:3] 36.1 38.1 39.6 40 40.6 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] -44 -42 -41.8 -40 -39.7 ... .. ..$ : num [1:56, 1:3] 36.1 38.1 39.7 40 40.9 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] -44 -42 -41.4 -40 -39.5 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] 36.1 38.1 38.9 40 40.3 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] -44 -42 -40.9 -40 -39.3 ... .. ..$ : num [1:58, 1:3] 36.1 38.1 39.3 40 40.4 ... .. ..$ : num [1:50, 1:3] -44 -42 -40.6 -40 -39.5 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] 36.1 38.1 39.5 40 41 ... .. ..$ : num [1:52, 1:3] -45.9 -44 -42 -40.1 -40 ... .. ..$ : num [1:52, 1:3] 38.1 39.9 40 41.4 41.9 ... .. ..$ : num [1:52, 1:3] -45.9 -44.8 -44 -42 -40 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] 38.1 38.4 40 40.6 41.7 ... .. ..$ : num [1:52, 1:3] -45.9 -44 -42 -41.9 -40.1 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] 38.1 39.9 40 41 41.8 ... .. ..$ : num [1:48, 1:3] -45.9 -44 -42.2 -42 -40.8 ... .. ..$ : num [1:52, 1:3] 38.1 40 40.7 41.6 42 ... .. ..$ : num [1:48, 1:3] -45.9 -44 -42.4 -42 -41.5 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] 38.1 39.1 40 41.3 42 ... .. ..$ : num [1:48, 1:3] -45.9 -44.1 -44 -42.6 -42.6 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] 38.1 40 40.5 41.8 42 ... .. ..$ : num [1:48, 1:3] -45.9 -44 -43.4 -42.7 -42.6 ... .. ..$ : num [1:54, 1:3] 38.1 40 41.3 42 42.1 ... .. ..$ : num [1:52, 1:3] -45.9 -44.2 -44 -43.1 -43.1 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] 40 40.2 41.9 42 43 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] -45.9 -44 -43.6 -43 -43.1 ... .. ..$ : num [1:24, 1:3] 45.9 47.5 47.8 47.9 49.2 ... .. ..$ : num [1:24, 1:3] -49.8 -47.9 -47.4 -46.8 -46.7 ... .. ..$ : num [1:16, 1:3] 40 40.8 42 42.4 43.2 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] -45.9 -45.5 -44 -43.8 -43.5 ... .. ..$ : num [1:26, 1:3] 45.9 46.4 47.9 48.1 49.3 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] -49.8 -47.9 -47.8 -46.8 -46.2 ... .. ..$ : num [1:12, 1:3] 40 41.7 42 42.6 43.2 ... .. ..$ : num [1:18, 1:3] -47.9 -45.9 -44.5 -44 -44.1 ... .. ..$ : num [1:24, 1:3] 45.9 47.9 48.2 49.4 49.8 ... .. ..$ : num [1:22, 1:3] -49.8 -49.5 -47.9 -47.1 -46.2 ... .. ..$ : num [1:12, 1:3] 40 41.3 42 43 43.4 ... .. ..$ : num [1:18, 1:3] -47.9 -45.9 -44.9 -44.5 -44.5 ... .. ..$ : num [1:24, 1:3] 47.9 48.5 49.6 49.8 50.8 ... .. .. [list output truncated] .. ..- attr(*, "dim")= int [1:2] 104 1 ..@ DVH :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. ..@ patient : chr "" .. .. ..@ ID : chr "" .. .. ..@ structure.name : chr "" .. .. ..@ structure.volume: num 0 .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. ..@ dose.max : num 0 .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. ..@ dose.mean : num 0 .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. ..@ dose.STD : num 0 .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. ..@ dose.rx : num 0 .. .. ..@ dose.fx : num 0 .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. ..@ doses : num(0) .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. ..@ volumes : num(0) .. .. ..@ volume.type : chr "relative"
The format for teeth
is:
Formal class 'structure.list' [package "RadOnc"] with 1 slots ..@ structures:List of 3 .. ..$ Tooth #1:Formal class 'structure3D' [package "RadOnc"] with 9 slots .. .. .. ..@ name : chr "Tooth #1" .. .. .. ..@ volume : num 0 .. .. .. ..@ volume.units : chr "cc" .. .. .. ..@ coordinate.units: chr "cm" .. .. .. ..@ vertices : num [1:324, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23.4 -22.5 ... .. .. .. ..@ origin : num [1:3] -25.2 -129.3 -100.7 .. .. .. ..@ triangles : logi[1:3, 0 ] .. .. .. ..@ closed.polys :List of 23 .. .. .. .. ..$ : num [1:14, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:20, 1:3] -28.3 -26.4 -25.8 -24.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -24.4 -24.1 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -24.4 -24.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -24.4 -23.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -28.3 -27.5 -26.4 -24.4 -23.1 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -26.2 -24.4 -22.8 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:20, 1:3] -28.3 -26.4 -25.3 -24.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:30, 1:3] -28.3 -27.9 -26.4 -24.4 -24.1 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:12, 1:3] -28.3 -26.6 -26.4 -24.4 -24 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -30.3 -28.3 -26.9 -26.4 -25 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -22.5 -20.5 -18.6 -17.9 -18.1 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -28.3 -28.2 -26.4 -24.4 -23.9 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -25.6 -25.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -20.5 -18.6 -17 -17.6 -18.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:16, 1:3] -28.3 -26.4 -25 -24.5 -26.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -20.5 -18.6 -17.4 -18.1 -18.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:14, 1:3] -28.3 -26.4 -25.1 -26.3 -26.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -18.6 -17.3 -18.3 -18.6 -20.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -30.3 -28.3 -27.4 -28.3 -30.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:4, 1:3] -18.6 -17.3 -18.6 -19.7 -128.7 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -30.3 -28.3 -27.5 -28.3 -30.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -18.6 -17.4 -16.8 -18.6 -20.4 ... .. .. .. .. ..- attr(*, "dim")= int [1:2] 23 1 .. .. .. ..@ DVH :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. .. .. ..@ patient : chr "" .. .. .. .. .. ..@ ID : chr "" .. .. .. .. .. ..@ structure.name : chr "" .. .. .. .. .. ..@ structure.volume: num(0) .. .. .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. .. .. ..@ dose.max : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.mean : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.STD : num 0 .. .. .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. .. .. ..@ dose.rx : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.fx : num 0 .. .. .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. .. .. ..@ doses : num(0) .. .. .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. .. .. ..@ volumes : num(0) .. .. .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ Tooth #2:Formal class 'structure3D' [package "RadOnc"] with 9 slots .. .. .. ..@ name : chr "Tooth #2" .. .. .. ..@ volume : num 0 .. .. .. ..@ volume.units : chr "cc" .. .. .. ..@ coordinate.units: chr "cm" .. .. .. ..@ vertices : num [1:338, 1:3] -26.4 -26.2 -24.4 -23.5 -22.5 ... .. .. .. ..@ origin : num [1:3] -25.1 -129.4 -100.9 .. .. .. ..@ triangles : logi[1:3, 0 ] .. .. .. ..@ closed.polys :List of 24 .. .. .. .. ..$ : num [1:16, 1:3] -26.4 -26.2 -24.4 -23.5 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -25.8 -24.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -24.5 -24.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23.9 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -24.4 -22.8 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -28.3 -27.1 -26.4 -24.4 -23.2 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -28.3 -26.4 -25.9 -24.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -25 -24.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:18, 1:3] -28.3 -26.4 -24.7 -24.4 -22.8 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -22.5 -20.5 -18.6 -17.8 -18.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:14, 1:3] -28.3 -26.4 -26.3 -24.6 -24.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -30.3 -28.3 -26.6 -26.4 -25.7 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -22.5 -20.5 -18.6 -17.9 -18.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -28.3 -27.5 -26.4 -24.6 -24.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -20.5 -18.6 -16.9 -16.8 -18.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -24.2 -24.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -30.3 -28.3 -27 -26.4 -28.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -20.5 -18.6 -16.6 -16.3 -16.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -28.3 -26.4 -25.3 -26.4 -28.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -30.3 -28.3 -27.1 -28.3 -30.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -18.6 -17.1 -17.6 -18.6 -18.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -30.3 -28.3 -26.9 -28.3 -30.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -18.6 -18.5 -16.6 -16.4 -16.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:4, 1:3] -18.6 -16.8 -18.6 -19.1 -129.4 ... .. .. .. .. ..- attr(*, "dim")= int [1:2] 24 1 .. .. .. ..@ DVH :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. .. .. ..@ patient : chr "" .. .. .. .. .. ..@ ID : chr "" .. .. .. .. .. ..@ structure.name : chr "" .. .. .. .. .. ..@ structure.volume: num(0) .. .. .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. .. .. ..@ dose.max : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.mean : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.STD : num 0 .. .. .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. .. .. ..@ dose.rx : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.fx : num 0 .. .. .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. .. .. ..@ doses : num(0) .. .. .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. .. .. ..@ volumes : num(0) .. .. .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative" .. ..$ Tooth #3:Formal class 'structure3D' [package "RadOnc"] with 9 slots .. .. .. ..@ name : chr "Tooth #3" .. .. .. ..@ volume : num 0 .. .. .. ..@ volume.units : chr "cc" .. .. .. ..@ coordinate.units: chr "cm" .. .. .. ..@ vertices : num [1:310, 1:3] -28.3 -26.4 -28.3 -29.4 -24.4 ... .. .. .. ..@ origin : num [1:3] -24.7 -129.4 -100.3 .. .. .. ..@ triangles : logi[1:3, 0 ] .. .. .. ..@ closed.polys :List of 24 .. .. .. .. ..$ : num [1:4, 1:3] -28.3 -26.4 -28.3 -29.4 -126.7 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -24.4 -22.5 -22 -22.5 -24.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:16, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -24 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -24.1 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23.6 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:24, 1:3] -28.3 -26.4 -25.2 -24.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -24.7 -24.4 -22.5 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:22, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -24.2 -22.9 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:14, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23.6 -24 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -22.5 -20.5 -18.6 -16.8 -17.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -28.3 -26.4 -24.4 -23.5 -24.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -28.3 -26.4 -26 -25.4 -26.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -20.5 -18.6 -16.6 -16.5 -16.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -28.3 -27.3 -26.4 -24.4 -24.2 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -30.3 -28.3 -26.4 -26.3 -26.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:10, 1:3] -20.5 -18.6 -16.6 -16.5 -16.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:16, 1:3] -28.3 -27.3 -26.4 -25.4 -26.4 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:8, 1:3] -20.5 -18.6 -16.7 -17.7 -18.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -30.3 -28.3 -27.2 -28.3 -30.3 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -18.6 -18 -17.6 -18.6 -20.1 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -30.3 -29.7 -28.7 -30.3 -30.6 ... .. .. .. .. ..$ : num [1:6, 1:3] -18.6 -16.7 -16.7 -18.6 -18.7 ... .. .. .. .. ..- attr(*, "dim")= int [1:2] 24 1 .. .. .. ..@ DVH :Formal class 'DVH' [package "RadOnc"] with 18 slots .. .. .. .. .. ..@ patient : chr "" .. .. .. .. .. ..@ ID : chr "" .. .. .. .. .. ..@ structure.name : chr "" .. .. .. .. .. ..@ structure.volume: num(0) .. .. .. .. .. ..@ type : chr "cumulative" .. .. .. .. .. ..@ dose.max : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.min : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.mean : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.median : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.mode : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.STD : num 0 .. .. .. .. .. ..@ conf.index : num 0 .. .. .. .. .. ..@ equiv.sphere : num 0 .. .. .. .. .. ..@ gradient : num 0 .. .. .. .. .. ..@ plan.sum : log FALSE .. .. .. .. .. ..@ dose.rx : num 0 .. .. .. .. .. ..@ dose.fx : num 0 .. .. .. .. .. ..@ rx.isodose : num 100 .. .. .. .. .. ..@ doses : num(0) .. .. .. .. .. ..@ dose.type : chr "absolute" .. .. .. .. .. ..@ dose.units : chr "cGy" .. .. .. .. .. ..@ volumes : num(0) .. .. .. .. .. ..@ volume.type : chr "relative"
The format for stomach
is:
Formal class 'zDVH' [package "RadOnc"] with 22 slots ..@ patient : chr "" ..@ ID : chr "" ..@ structure.name : chr "STOMACH" ..@ structure.volume: num 699 ..@ type : chr "differential" ..@ dose.max : num 53.6 ..@ dose.min : num 0.594 ..@ dose.mean : num 12.5 ..@ dose.median : num 0 ..@ dose.mode : num 0 ..@ dose.STD : num 0 ..@ conf.index : num 0 ..@ equiv.sphere : num 0 ..@ gradient : num 0 ..@ plan.sum : log FALSE ..@ dose.rx : num 55 ..@ dose.fx : num 25 ..@ rx.isodose : num 100 ..@ doses : num [1:114] 0.125 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 4 4.5 ... ..@ dose.type : chr "absolute" ..@ dose.units : chr "Gy" ..@ volumes : numeric [1:114, 1:48] 0 0 0 0 0 ... .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2 .. .. ..$ : NULL .. .. ..$ : chr [1:48] "-96" "-93" "-90" "-87" ... .. ..- attr(*, "class")= chr [1:2] "numeric" "matrix" ..@ volume.type : chr "absolute"
Examples
data(list="RadOnc",package="RadOnc")
[Package RadOnc version 1.1.8 Index]