CoordenadasPrincipais {MultivariateAnalysis}

Estudo de coordenadas principais

Description

Esta funcao possibilita o estudo dos coordenadas principais.

Usage

CoordenadasPrincipais(Dist, layout = 1,
main = NULL, NomeTrat = NULL, xlab = "PCoA 1", ylab ="PCoA 2",
ColVars = c(1, 2), CR = TRUE, Perc = 0.01, plot = TRUE)

Arguments

Dist

Matriz com as medidas de dissimilaridade.

layout

Deve ser um numero variando de 1 a 8. Para cada numero teremos um layout diferente.

main

Titulo do grafico.

NomeTrat

Nome dos tratamentos.

xlab

Nome do eixo x no grafico.

ylab

Nome do eixo y no grafico.

ColVars

Numero dos eixos que se pretende apresentar no grafico. O padrao e 'c(1,2)'.

CR

Valor logico (TRUE ou FALSE) indicando se aparecera no grafico a contriuicao relativa de cada eixo.

Perc

Valor entre 0 e 1 indicando o recuo dos eixos.

plot

Valor logico.Se for TRUE o grafico sera apresentado.

Value

Esta funcao retorna informacoes importantes para o estudo de coordenadas principais.

References

PlayList "Curso de Analise Multivariada": https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK72M3lFl7kBaHiVh5W53mlR

Cailliez, F. (1983) The analytical solution of the additive constant problem. Psychometrika, 48, 305–308.

CRUZ, C.D. and CARNEIRO, P.C.S. Modelos biometricos aplicados ao melhoramento genetico. 3nd Edition. Vicosa, UFV, v.2, 2014. 668p. (ISBN: 8572691510)

FERREIRA, D.F. Estatistica Multivariada. (2018) 3ed. UFLA. 624p. (ISBN 13:978 8581270630)

Paradis, E.; Schliep, K. ape 5.0: an environment for modern phylogenetics and evolutionary analyses in R. (2019) Bioinformatics. 526-528.

HAIR, J.F. Multivariate Data Analysis. (2016) 6ed. Pearson Prentice HalL. (ISBN 13:978 0138132637)

Lingoes, J. C. (1971) Some boundary conditions for a monotone analysis of symmetric matrices. Psychometrika, 36, 195–203.

See Also

ComponentesPrincipais

Examples

#Exemplo com dados Quantitativos
data("Dados.MED")
Dist=Distancia(Dados.MED,Metodo=5)
CoordenadasPrincipais(Dist)
#Compare os resultados com os componentes principais
ComponentesPrincipais(Dados.MED,padronizar = TRUE)

#Exemplo com dados Qualitativos

data=data("Dados.CAT")
Dist=Distancia(Dados.CAT,Metodo=10)
CoordenadasPrincipais(Dist)